创业中心下设五个部，分别为：
　　综合服务部（办公室）：主要负责中心综合人事行政管理、文秘、宣传推介、对外联络、来访接待、配套服务和物业管理、安全保卫。
　　项目发展部：主要负责入孵项目的招商、在孵企业的监管调度、考核评价以及毕业认定等工作。包括从项目洽谈、评审、入驻手续办理到企业进驻，企业在孵化过程中的项目研发、经营发展等方面的监管调度，阶段性考核评价、毕业审查、认定以及有关优惠政策落实等。
　　企业服务部：主要负责为入孵企业提供各类人性化服务。包括为孵化企业办理工商注册、税务登记、机构代码、环保审批等事宜。
　　科技管理与服务部：为企业提供经营管理及专业技能培训、科技信息咨询与技术难题诊断以及宣传推介等方面的支持；提供专利申请、科技计划申报、技术成果鉴定、高新技术企业认定等服务
　　财务运营部：主要负责创业中心的资产运营、资本运作以及财务工作；负责管理创业中心种子资金，并对种子资金的使用情况进行监管、核算；帮助孵化企业融资、争取有关的扶持资金、专项贷款和风险投资；负责统计孵化企业经济运行状况并进行分析，协助孵化企业做好相关的会计事务工作等。